公办的。

1. "福建农林大学"是一个公办大学，"金山学院"是福建农林大学下辖的一个本科院系，因此是公办的。

2. 与其他民办大学相比，公办大学在人力、物力、财力以及社会资源等各个方面都有较为充裕的保障。所以可以肯定地说，“福建农林大学金山学院是公办的”。

福建农林大学 金山学院是一所民办高校,该校是2006年国家教育部批准成立的全日制本科层次独立学院,也是迄今为止唯一的国家级中外合作办学项目的学院。