海陵中学南校区与本部有以下几个区别：

1.海陵中学南校区位于海陵岛，而本部位于海陵市；

2.海陵中学南校区拥有更多的室外活动场地，而本部拥有更多的室内活动场地；

3.海陵中学南校区的教学设施更加先进，而本部的教学设施较为简单；

4.海陵中学南校区的师资力量更加雄厚，而本部的师资力量较为有限。