南京航空航天大学的应用物理学专业主要侧重于光电子技术、微电子技术、激光技术、纳米材料与技术、新能源技术等方向。学生需要掌握物理学的基本理论、基本知识与实验技能，以及电子技术、光电子技术、微电子技术、激光技术、纳米材料与技术、新能源技术等领域的基本理论、基本知识和基本技能。

此外，该专业还注重培养学生的实践能力、创新能力、团队协作能力和组织管理能力，使学生具备较强的科技应用能力，能在科研机构、高等学校、企业等单位从事科研、教学、技术开发、生产管理等工作。

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