微生物学上说的菌落是单个细菌（或其他微生物）细胞或一堆同种细胞在适宜固体培养基表面或内部生长繁殖到一定程度，形成肉眼可见的子细胞群落，是一群细胞群落； 菌株是由一个独立分离的单细胞（或单个病毒粒子）繁殖而成的纯种群体及其后代，菌株实际上是某一微生物达到“遗传性纯”的标志，一种微生物的每一个不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一个菌株。