上海海洋大学在水产、生物学、食品科学与工程方面实力不错，其他相对一般。而华南农业大学在农业工程 ，生物学，作物学，园艺学，生态学，农业资源与环境，植物保护学 ，畜牧学，兽医学，食品科学与工程，草学，农林经济管理等领域实力比较强。整体实力华南农业大学肯定是强于上海海洋大学的。