昌吉学院采用的是“专业优先（专业清）”的招生方式。也就是说，在招生时，首先按照考生填报的专业志愿，将考生分配到相应的专业中，然后再按照考生的分数进行排序，确定录取名单。这种方式可以保证考生的专业志愿得到优先满足，同时也有利于高校更好地管理和培养人才。