山东农业大学的实力胜过鲁东大学，毕竟山东农业大学更具特色，优势领域更加明显。

鲁东大学和山东农业大学两所学校虽然主力教研领域并不相同，但是两所学校相对山东省内众多的双非高校而言，实力确实比较强，影响力也比较大，所以山东省学子相对更重视这两所学校，属于山东省内知名高校。

鲁东大学，也设有农学院，是以鲁东大学菌物科学与技术研究院和原属生命科学学院的水产养殖专业的基础上成立了鲁东大学农学院。不过，鲁东大学的农学院实力并不强，只有园艺、农学、水产养殖三个本科专业，以及园艺、水产硕士点。相对山东农业大学来讲，鲁东大学的农学院绝对是小巫见大巫，差距不是一星半点，毕竟山东农业大学在农业方面深耕多年，具有完整的教学系统。

鲁东大学，是师范起家的高校，前身是烟台师专，所以他在文理方面实力相对比较强。他的第一个工科二级学院，是交通学院，主要是因为合并了1978年成立的山东省交通学校，以此为基础组建而成。鲁东大学的交通学院主要开设交通运输、机械制造、物流、船舶、车辆，其中实力最强的当属交通运输，这是他最早开设的专业，而且基础设施和附属教学系统也是最为完善的专业，所以相对更具优势一些。

山东农业大学，早在1983年就晋级“大学”行列，他是山东省内农业类高校中第一学府，属于农业综合性全领域高校，在作物栽培、果树领域实力较强，这也是他能成为山东省、国家林业局、农业部共建高校的重要原因之一。

从地理位置上来讲，鲁东要好很多，因为一个是靠海，这个优势是内陆无法达到的，而且这边的生活水平和人际交往以及社会形态的变化都是内陆城市少有的，开放程度也要好于内陆，当然不是说内陆不好，你说的两所大学是学分互认的，从规模和整体来看是差不多的，但就地方的优势来讲，还是建议你来鲁东大学。