水利类专业：农业水利工程、水利水电工程、热能与动力工程

土建类专业：农业建筑环境与能源工程、土木工程

其中热能是农大水院最强的，尤其是水轮机方面的研究排在全国前列，水利水电是2000年左右开设的学科，相对来说是最弱的，农水相对水利水电来说是一般研究一些小水利工程和水土之类的，偏重于科研型。