学校前身为1952年创建的黄冈专区农业学校；1958年，升格湖北林业专科学校；2002年，经湖北省人民政府批准,湖北省林业学校升格为湖北生物生态职业技术学院（原湖北省林业学校部分）；2004年5月，经湖北省人民政府同意，湖北生物生态职业技术学院（原湖北省林业学校部分）改建为湖北生态工程职业技术学院