参考志愿优先。因为填写志愿是决定录取结果的关键，只有填写了符合实际情况和个人意愿的志愿，才有可能被录取。而指标生只是在满足一定条件的情况下，可以获得特定的优惠政策，不是录取的必要条件。此外，填写志愿时需要充分考虑自身的情况，包括个人兴趣爱好、专业背景、竞争情况等等，而指标生只是一项待遇政策，不应该成为选择专业的主要因素。因此，我们应该首先填写适合自己的志愿，然后再考虑是否符合指标生的条件。