南通大学和江苏科技大学都是省部共建的省属重点大学，都还不错。专业侧重不一样。江苏科技大学学科门类比较窄，侧重船舶。南通大学学科门类比较齐全，很多学科专业是江苏科技大学没有的，比如医学专业等等。