两所学校都是高职院校，在专业方面，都互有特长，内蒙古可以职业学院偏人文管理，鄂尔多斯职业学院偏理工科。个人建议，鄂尔多斯职业学院好一些，因为这所学校，开设的专业都是鄂尔多斯地方特色产业所需要的专业，例如煤炭类、化工类、资源类，鄂尔煤炭、化工等领域的大型企业特别多，所以这些专业毕业后，非常好就业，选择余地很大。