交管12123交费直接进入驾考中心账户，驾校交费原则上也是要进入驾考中心账户，但驾校有可能会出现拖延，漏交或者恶意不交，这样就会影响到你的科目考试，甚至是考试通过后领取不到驾驶证

没有区别，效果一样。但是12123缴纳考试费更加快捷支付，而且微信，支付宝，银行卡多种形式可以支付，比驾校缴纳要直观方便的多。

所缴费用性质不同。在交管12123上面缴纳的是考试所需要的费用,在驾校缴纳的是学车的费用,两者缴纳费用的性质不同,因此都要缴。