牡丹江共有7所大学，名单分别为牡丹江医学院、牡丹江师范学院、牡丹江大学、黑龙江林业职业技术学院、黑龙江农业经济职业学院、黑龙江商业职业学院、黑龙江幼儿师范高等专科学校。