福建工程学院王牌专业有土木工程、工程造价、电气工程及其自动化、交通运输工程、材料科学与工程、机械工程、管理科学与工程、交通信息工程及控制、材料加工工程、岩土工程、结构工程、机械电子工程、管理科学与工程、车辆工程、电力系统及其自动化、环境工程。