两者的区别在于：

中医馆一般的大夫都具有西医常识，能从中医、西医角度来考虑。而国医堂的大夫多为传统中医大夫，他们中医知识十分牢固，相对的西医常识比较薄弱。

相比之下，一般中医馆规模比较大，所以病人较多；而国医堂规模较小，所以病人相对少一些。

两者本质上没有什么区别，都是围绕我们传统中医进行医疗服务的机构。