安徽医科大学位于安徽省合肥市，现有三个校区，分别为梅山路校区、翡翠路校区和东校区，南边新医科中心也正在建设中，不久后将投入使用。学校共设20个直属机构，今年在安徽招生的本科专业共计46个，包括临床医学、临床药学、麻醉学、医学影像学、口腔医学、生物技术、预防医学、药学、医学检验技术、公共事业管理、应用心理学等12个国家级一流本科专业及多个省级一流本科专业。学校各专业分属不同学科门类，因此医学及相关学科门类相对齐全，培养体系也相对完整。

有梅山路校区、翡翠路校区、东校区（在建）、巢湖校区、阜阳校区等5个校（院）区；校区不分专业，低年级学生在梅山路校区学习，高年级学生在各自临床医学院院区学习。