双高计划高水平专业群建设名单：航海技术、安全技术与管理

国家示范院校重点建设专业：汽车检测与维修技术专业、道路桥梁工程技术专业、航海技术专业、轮机工程技术专业、机电一体化技术专业、安全技术管理专业、物流管理专业、计算机应用技术专业

全国职业院校交通运输类示范专业点：汽车检测与维修技术、航海技术

全国职业院校装备制造类示范专业点：机电一体化技术

福建船政交通职业学院有很多专业，每个专业都有其优点和特色，不能简单地给出一个“最好”的答案。不过，根据福建船政交通职业学院的官方介绍，该学院的交通运输类、机械类、管理类专业颇受学生欢迎，其中包括交通运输管理、船舶与海洋工程、物流管理、航海技术、物流工程技术等专业。