一个是中外合作办学，一个是其他专业，毕业证没有区別。江西中医药大学（Jiangxi University of Traditional Chinese Medicine），是国家中医药管理局与江西省人民政府共建高校，是国家博士学位授权单位，是卓越医生（中医）教育培养计划改革试点高校，是中央统战部、国家民委、教育部指派的对口支援西部的高校

关于这个问题，江西中医药大学有两个代码是因为该学校曾经更名，原名为江西中医学院，后改为江西中医药大学，但在某些系统中可能仍保留原有的代码。此外，不同的代码可能对应不同的学科、专业或机构等，需要具体查询了解。