学院设有临床医学(五年制、八年制)、预防医学、药学、口腔医学（五年制、“5+3”）、护理学、医学检验与技术、麻醉学、精神医学、基础医学、生物信息学、法医学、生物医学工程、生物科学13个本科专业。

拥有基础医学院、公共卫生学院、口腔医学院、药学院、生命科学学院、护理学院等6所学院，有湘雅医院、湘雅二医院、湘雅三医院、湘雅口腔医院4所直属附属医院。

中南大学湘雅医学院拥有九个国家重点学科。分别是病理性与病理生理学专业，遗传学专业，药理学专业，精神病与精神卫生学专业，精神病学专业。空心外科学专业，内科学专业内分泌与代谢病学，耳鼻烟喉科学专业，普通外科学专业，药理学与毒理学专业

湘雅医学院的王牌专业可以说有很多。其中公认并且在国内享有一定知名度的专业，主要是神经内科和神经外科。作为百年的湘雅医院。从成立以来便是国内的神经内科和外科的奠基者之一。就目前而言，神经内外科在国内医院内的排名也是属于前10名之内。所以在湘雅医学院内这个学科也是享有非常高的声誉度。