看目的，

如果你在乎的是，当有均值差异存在时，ANOVA和两两比较有同样的敏感度(或检出力)，就把所有两两比较的结果看做一个整体。应选择Tukey法，累积误差95%，单次两两比较的第一类错误大约为95%开n次方。

ANOVA还是两两比较都是为了检出差异。至于第一类错误，可以看成是对于无差异情况的检出力。

你可以把两者看做序贯的过程，先用ANOVA检出整体的差异，再用两两比较得出差异的主要来源。

有点类似列联表卡方检验，先算出整体显著性，再一个个看哪几格是主要的贡献方。这时你不能抽出几个单独算。

如果仅仅就是想看其中两组谁大谁小，当然可以选Fisher法，设定单次95%，也就等同于两样本t检验。

如果目的是比较对照组，算法又不同。

多组间的比较可以用单因素方差分析看看多组间是否存在显著差异，如果存在显著差异，再用事后对比检验两两分析看看究竟是哪两个组之间存在着显著差异？