南京大学官网上就没有植物保护学院，提问问错了，应该是南京农业大学植物保护学院。

南京农业大学植物保护学院是一本，是我国近代植物病理学、昆虫学及植物检疫事业的发祥地之一。学院肇始于1921年东南大学（三江师范学堂发展而来）设立的全国最早的病虫害系，1952年院系调整，与金陵大学植物病虫害系（1941年成立）合并成立南京农学院植物保护学系，2000年更名为南京农业大学植物保护学院。

是一本，本身南京大学是国内一流的综合大学，植物保护是目前国家倡导的环保专业，所以它是一本。