总体上两所大学是一个层次的大学，都是省属重点大学，学校实力相当。但南华大学是综合性大学，山东理工偏理工类大学。对两所大学的选择，关键看自己的意愿。

机械工程、电气工程、农业工程等学科是山东理工大学的强势学科。核科学与技术、矿业工程、基础医学等学科是南华大学的强势学科。就看自己今后就业的意愿行业。