南京农业大学食品科技学院现任院长是：徐兴莲教授，正处级。

副院长：屠康教授，副处级。

前任院长：陆兆新教授，任期满后，正处级巡视员。

值得一提的是，陆兆新院长的上一任院长，是周光宏教授（同期兼任动物科技学院院长），现在任南京农业大学校长（正厅），中国畜产品加工学会会长。