区别如下：

第一，地点不一样，荣昌校区在重庆市荣昌区，西南大学主校区在重庆市北碚区。

第二，专业分布不一样，荣昌校区主要是分布的有动物科学专业，动物医学专业，主校区有理科，文科，工科等等。