华侨大学厦门校区共有15个学院，涵盖着理、工、文、管、法、经、教育学和体育等多个领域，拥有本科、硕士和博士等多种不同层次的教育形式。

其主要的本科专业有包括机械、自动化、计算机科学与技术、物流管理、市场营销、国际经济与贸易、德语、日语、汉语言文学、外国语言学及应用语言学、教育学、体育教育、新闻传播学等。因此，华侨大学厦门校区的专业涵盖了众多领域，且各个专业的教学水平也得到了社会的广泛认可。