差不多，都不是国家211工程高校，算是三流的本科院校吧。南京工业大学是江苏高水平大学建设高峰计划A类建设高校，一级学科博士学位授予点9个、一级学科硕士学位授予点29个。北京建筑大学是北京市和住房城乡建设部共建高校，有一级学科博士学位授权点2个，一级学科硕士学位授权点14个。

北京建筑大学除了校址在北京比较好，别的方面南京工业大学都强。