微生态的第三大功能是免疫调节。微生物可以通过与宿主免疫系统的相互作用来调节免疫反应，促进免疫细胞的发育和增殖，增强免疫系统的防御能力。

同时，微生物还可以抑制炎症反应，减轻免疫系统对自身组织的攻击，从而保持身体的免疫平衡。