在杂合子细胞中，位于一对同源染色体上的等位基因，具有一定的独立性；当细胞进行减数分裂时，等位基因会随着同源染色体的分开而分离，分别进入两个配子当中，独立地随配子遗传给后代。 基因分离定律与基因自由组合定律、基因的连锁和交换定律为遗传学三大定律。

三种验证方法：

1、测交法：将杂种子一代与隐性纯合子杂交，观察子代表现型分离比，应为1：1。

2、自交法：将杂种子一代进行自交得子二代，子二代表现型分离比应为3：1。

3、花粉鉴定法：有的植物花粉中存在淀粉，而含等位基因的花粉中则没有。利用碘与花粉中淀粉反应显色的现象，来计数变蓝与不变蓝的花粉数量。其比例应为1：1