主要区别是属性不同。

外科学专硕培养方向一般是临床医学范畴，属于医学应用专业领域。

外科学学硕培养方向一般是学术课题研究范畴，属于医学理论研究领域。

外科专硕偏向于临床实践能力培养，学硕偏向了科学研究能力培养。