复旦大学和中科院上海微系统研究所都是非常优秀的学校，但是它们的专业和研究方向不同。

复旦大学是一所综合性大学，拥有多个学科门类，包括文学、历史、哲学、经济、法律、教育、自然科学、工程技术、医药卫生等。而中科院上海微系统研究所则是中国科学院下属的一所研究机构，主要从事微电子技术及其应用的研究。

因此，您需要根据自己的兴趣和职业规划来选择适合自己的研究生院校。如果您对微电子技术感兴趣，那么中科院上海微系统研究所可能更适合您；如果您想要全面发展自己的知识体系

复旦就电子这一块比较厉害，微所的话电子和通信都不错。在电子方向复旦的考研难度远大于微所，通信的话复旦很一般，应该不是很难。哪个好看个人修为了，这样的平台都够你用了。看自己喜欢的氛围吧。