方案是第一阶段，经过五年奋斗，实现更名大学目标，达到博士学位授予单位建设基本要求。

第二阶段，再经过五年奋斗，获批博士学位授予单位。

第三阶段，到建校80周年，建成国内有影响、特色鲜明的区域性高水平医科大学……日前，皖南医学院为更名大学目标设立了时间表。