吉林大学管理科学与工程系是历史悠久、学科齐全的系之一，拥有一级学科博士学位授权点和博士后流动站。教师22人，其中教授10人，博士生导师10人，副教授7人，博士化率100%。该系承担了多项国家自然科学基金和部委研究课题，同时也承担多项校企合作的重大研究项目。研究生教育依托管理科学与工程一级学科，主要研究方向为信息系统与商务智能。