学院现设有临床医学、口腔医学、护理学、药学、医学影像学、医学检验、康复治疗学、公共事业管理(卫生事业管理方向)、劳动与社会保障(医疗保险方向)、信息管理与信息系统(计算机技术医药卫生应用方向)、环境科学(环境医学方向)、英语(医药卫生方向)等13个本科专业及专业方向，涵盖医、理、文、管等多个学科。

临床医学专业、护理学专业为省级特色专业，是具备良好教学环境和条件的现代高等学校，面向全国31个省、区、市招生，目前本科全日制在校生近7000人。

昆明医科大学海源学院有临床医学、口腔医学、医学影像技术、医学检验技术、药学、康复治疗学、眼视光学、中药学、制药工程、护理学、助产学、运动康复、健康服务与管理、财务管理等专业，以下是具体名单一览表，供大家参考，由于专业设置可能会变动，正式填报时需要以学校最新公布的数据为准。