云南水利水电职业学院有多个学院。

1. 云南水利水电职业学院设有水利工程学院。该学院主要培养水利工程专业的相关人才，包括水利工程管理、水利水电工程设计与施工等方面的知识和技能。

2. 云南水利水电职业学院还设有机电工程学院。该学院主要培养机电工程相关专业的学生，包括机电设备维修与管理、自动化工程技术等方面的学习内容。

3. 另外，云南水利水电职业学院还有土木工程学院，该学院主要培养土木工程相关专业的学生，涉及到土木工程设计、施工管理等方面的知识。所以，云南水利水电职业学院共设有三个学院。