通常在自身APC表面，一种外源性抗原肽含有的抗原表位数目有限，与自身MHC分子结合后在APC表面表达的密度很低，而同种异型移植物中，供者APC所有不同MHC基因座编码的MHC分子均可形成不同表位，因而供者APC表面表达的移植抗原的密度很高，而且每一同种型MHC分子可空载或结合自身抗原肽或结合外源性抗原肽，从而形成数目众多的pMHC分子，激活不同克隆的T细胞。