基因的检测方法通常有两种：

1. 形态检测（个体水平检测方法）：

如果目的基因的表达产物具有明显的表现性状，则可以根据目标性状的有无判断目的基因是否表达；如果目的基因产物没有明显的表现，通过检测标记基因（所用标记基因通常是抗生素抗性基因或荧光标记基因）的表达情况来检测目的基因的表达。

2. 分子检测（分子水平检测方法）

如PCR检测，分子杂交检测。