1、区别很大。重庆医科大学明显比遵义医科大学更受欢迎。

2、重庆医科大学在全国的医科大学排名中，能够进入前10名。属于医科大学中的第一集团。而遵义医科大学应该排到50名以后去了。

3、重庆医科大学毕业生在全国都比较受欢迎，而遵义医科大学的学生基本局限在西南地区就业。

重庆医科大学教学质量更好。

重庆医科大学拥有丰富的教育资源和强大的师资力量，教学质量非常好。学医考研比遵义医科大学更好。