国立高雄大学以三个圆点呈现“高”字的概念化表象，点由小而大，就像种子的成长、发芽，也象征海浪，有如泉涌般前进的动力。不用英文为设计，而以中文“高”字为设计，乃因着眼未来高雄大学的知名度推展到国际时，必须有属于自己民族的文化特色与源由。

色彩上以明亮的橙黄色传达出本校活泼、乐观、创新的印象，而灰色是最能和任何色彩搭配，是最具沉稳与包容性的色彩。此校徽色彩传达出活泼、乐观、创新、沉稳、包容，也是在课本之外，学子在生活上所应培养的学习态度。