生物酶工程是利用基因重组技术和生物化学方法，将生物体内的酶基因转移到其他生物体中，并通过改良酶的表达及操作条件，以生产特定的生物催化剂，从而实现对废水处理、生物燃料生产、医药、食品等领域的应用。

化学酶工程通常是指利用化学合成或改性方法，来改进酶催化反应的效率、特异性和稳定性。

这两种工程形式都旨在利用酶的优势，通过不同的方法来实现对酶的改良和利用。

生物酶工程是通过生物菌培养，化学酶是人工化学反应生成的菌酶培养。