上海应用物理研究所的主管部门是中国科学院。

中国科学院上海应用物理研究所，别名应用物理所，位于上海市嘉定区，

应用物理所筹建于1958年10月，1959年8月正式成立，时称中国科学院上海原子核研究所，2003年6月经国家批准定为现名。

中国科学院上海应用物理研究所以光子科学、核科学技术及相关交叉学科研究为主，同时推进科研成果产业化。