学院设有地理科学（理科）、城乡规划（工科）、环境工程（工科）3个学校扶持专业，“绿洲城市地理与环境过程”和“寒旱区环境污染绿色治理与修复”2个扶持学科， “资源与环境”1个申硕学科，“地理与生态环境学科团队”1个华东师大对口支援学科团队以及“甘肃省矿区污染治理与生态修复工程研究中心”1个省级工程研究中心。