泉州医学高等专科学校比较好。作为两所医学类专业的学校，福建卫生职业技术学院和泉州医学高等专科学校都有其各自的优势和特点。

泉州医学高等专科学校是一所拥有较为丰富的医学资源和基础设施的学校，其教学、科研水平也备受肯定，学校的师资力量也比较雄厚。

而福建卫生职业技术学院是一所技术性较强的学校，其医学类专业教学质量得到了广泛认可。学校拥有一支高水平的师资力量，同时也注重实践教学，为学生提供了丰富的实践机会。