成都中医药大学有多个专科专业，包括社会体育、应用日语、旅游管理、卫生信息管理、卫生监督、卫生检验与检疫技术、医学营养医学生物技术、医学检验技术、药学、护理、针灸推拿、临床医学、医药营销、药制药技术等。此外，成都中医药大学还有药学院、针灸推拿学院、民族医药学院、第二临床医学院、公共卫生学院、医学技术学院、护理学院、医学信息工程学院、管理学院等。