河南医学高等专科学校专业设有医学系、护理系、药学系、医学技术系、检验系5个系，开设有临床医学、护理、医学检验技术、医学美容技术、医学影像技术、眼视光技术、药学、药品生产技术、康复治疗技术等20个专业(方向)，其中护理专业是河南省特色专业，医学影像技术专业、医学检验技术专业是河南省高等学校综合改革试点专业。