高等教育研究所成立于1986年，主要承担有关高等教育问题的理论和实证研究、本校改革发展的调研和咨询、以及研究生培养等任务。高等教育研究所的前身是教务处辖下的高教研究室，1986年1月正式成立独立建制的高等教育研究所。主要培养课程与教学问题研究高级专门人才。教育经济与管理专业博士学位点（2012年获准授权，2013年首次招生），主要培养具有本学科重大问题研究能力的高级专门人才