南京林业大学目前尚没有下设的独立学院。但南京林业大学下设分院或校区还是客现存在的。如：

南京林业大学南方学院，位于江苏淮安市，是1999年经江苏省教育厅批准，按照新机制、新模式举办的民办二级学院，但南方学院正在积报申报独立学院。