博物馆部门负责人是指博物馆这个事业单位的领导，比如，市博物馆一般是事业单位，市博物馆馆长就是事业副处级事业单位的负责人，而县级博物馆一般是副科级事业单位，那么县级博物馆馆长就是县副科级事业单位的负责人。

事业单位机构改革后，博物馆被定为一类事业单位，所以馆长是事业单位负责人。