直肠指诊可以检查肛管、直肠等肠道疾病，比如痔疮、直肠息肉、直肠癌等，以及前列腺、精囊的疾病，前列腺增生，前列腺占位，骨盆内肿块，阑尾炎、髂窝脓肿、子宫和输卵管病变等，以及采取粪便标本及前列腺炎的检查，和直肠活检组织检查标本。