若毕业证和档案被大学扣押，通常需先解决导致扣押的问题，如学费欠缴等。接着，向学校相关部门提交书面申请，说明理由。遵照学校规定流程，可能还需提供身份证明及补交材料。一旦学校同意，按指示完成后续步骤即可取出。务必保持与校方的良好沟通。